पुराणों के अनुसार, भगवान ब्रह्मा ने महाकालेश्वर मंदिर परिसर में पहला मंदिर स्थापित किया था। 4 ईसा पूर्व के उज्जैन के पुराने सिक्कों में भगवान शिव के चित्र हैं। कालिदास ने मेघदूतम..आदि जैसे कई कविताओं में महाकालेश्वर मंदिर की प्रसिद्धि का चित्रण किया है। महाकालेश्वर ज्योतिर्लिंग का प्रसिद्ध मंदिर शहर के मध्य में स्थित है।